Škola byla ve Zdíkově zřízena v roce 1882 (do té doby zdejší žáci navštěvovali školu ve Zdíkovci). Na stavbu školní budovy z iniciativy Františka Antonína hraběte Thun-Hohensteina přispěl dvěma sty zlatých i císař František Josef I. V prvním školním roce (1882/1883) nastoupilo 380 žáků a prvním řídícím učitelem se stal významný pedagog Jan Evangelista Žlábek.
V roce 1948 byl v budově zřízen dětský útulek a v roce 1951 mateřská škola, která zde setrvala až do roku 1957, kdy byla přemístěna do zdíkovského zámku. V letech 1946–1964 mělo v budově své zázemí také zdejší populární loutkové divadlo.
V roce 1954 se obecná škola přestěhovala do zámku a v roce 1956 začaly práce na adaptaci budovy pro zdravotní středisko.
V roce 2002 byla budova prodána do soukromých rukou a adaptována na šest bytů a kanceláře exekutorského úřadu.